Harran'ı n ortasında yer alan 22 metre yüksekliğindeki höyük, oldukça geniş bir alana yayılmıştır. Tarih öncesi dönemlerden M.S. XIII. yüzyıla kadar kesintisiz olarak iskân edilen Harran höyüğü, içersinde çeşitli dönemlere ait mimari kalıntıları ve bölgenin tarihini gün ışığına çıkartacak belgeleri barındırmaktadır.
Höyükte ilk kazı 1951 yılında D.S.Rice tarafından başlanmış ve Aralıklarla 1956 yılına kadar devam etmiştir. 1983 yılında Dr. Nurettin Yardımcı başkanlığında yeniden başlayan kazılarda, yukarıda bahsedilen dönemlere ait çeşitli buluntular ele geçirilmiştir.
Üst tabakada geniş bir alana yayılmış olarak ortaya çıkartılan XIII. yüzyıl İslami dönem şehir kalıntısındaki su kuyuları, avlulara açılan odalar, kare ve dikdörtgen planlı, bitişik nizamlı evler, bu evlerin oluşturduğu dar sokaklar ve ortasında büyük bir kuyunun yer aldığı meydanlar, o dönemin İslam şehirleri ve konut mimarisi hakkında önemli bilgiler verir.
Kazı lardan elde edilen çok sayıdaki çivi yazılı tuğla, İslami dönem sikkesi, sırlı ve sırsız seramik kaplar, taş aletler, çeşitli süs eşyaları, madeni eserler, idol ve hayvan figürinleri Şanlıurfa Müzesi'nde sergilenmektedir.